细菌和病毒虽然都是常见的导致疾病的元凶，引起的症状可以相似，但是它们之间的区别可大了。
细菌尚属于我们可以理解的单细胞生物，而病毒已经没有了细胞结构，它只不过是一段遗传物质，包裹了一个蛋白质外壳而已，它根本就不像一种生物，而是介于生命和非生命之间的一种奇特的物质形式。
（两类病毒的基本结构——裸露病毒和囊膜病毒）
（细菌的基本结构要复杂得多）
从大小上区别：
细菌很大，以球菌为例，直径一般在0.5-1微米之间，用普通光学显微镜就能够看到。
病毒很小，以甲型H1N1流感病毒为例，大小只有90纳米，只有通过电子显微镜扫描才能够被看到。
从致病原理上来区别：
细菌是能够独立完成所有生物功能的单细胞生物。它可以分泌一些酶来破坏周围的组织结构，还能分泌一些毒素，引起发热等全身反应。
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而病毒没有实现新陈代谢所必需的基本系统，所以病毒它自身没有生理功能。但是当它接触到宿主细胞时，便脱去蛋白质外套，它的遗传物质可侵入宿主细胞内，借助宿主细胞的复制系统，按照病毒基因的指令复制出新的病毒。
当病毒在细胞内大量复制以后，细胞被裂解，大量病毒释放出来，开始继续寻找下一个目标。
从治疗的角度来看：
我们用来治疗细菌感染的抗生素的主要作用机理，要么是破坏细菌的细胞壁或者细胞膜，要么是干扰细菌蛋白质的合成或者阻碍细菌DNA的复制。
病毒因为结构与细菌完全不同，所以使用抗生素是无效的。同时因为病毒是寄生在细胞内部，很多药物难以达到，在杀灭病毒的同时，我们还要保证细胞不遭受破坏，难度就更大了。所以迄今为止，我们都没有找到对付病毒的特别好的办法。
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